不知道题主说的做笔记是指用笔书写还是键盘输入，下面从我自己做笔记比较关注的几个方面来分析各自优劣。
首先，平板做笔记首先要便捷快速，随叫随到，因为有可能一个好的想法有可能随着十几二十秒的开机时间耽误掉，这方面ipad胜出，合上休眠打开即用，surface如果短时间休眠激活的速度也就二三秒，也算不错，但是稍微时间长点就变成睡眠了，要唤醒要再多个两三秒，一来一回比起ipad的翻盖即用还是有那么一点点的差距。
其次如果用键盘要求输入迅速准确，这里又分为实体键盘和虚拟键盘，实体键盘两者都很方便准确，键盘手感surface 略胜一筹，虚拟键盘还是ipad的触感和准确度更高，拼音输入纵使打错一两个字母在联想输入词组的时候还是可以准确选出想要的词，更有丰富的第三方输入法，所以我觉得ipad虚拟键盘更好。
第三如果用笔输入要求书写准确度和仿真度（毕竟模拟笔记本），这点上两者的笔都很准确连贯，都能达到做笔记正常书写的标准，但是非要分出胜负苹果笔感觉更精准流畅一点。
第四就是系统软件的功能性，做的笔记毕竟是拿来用的，输出便捷和搜索方便都是考察要素，不管是印象笔记还是苹果自带的备忘录，我个人觉得还是没有微软的one note好用，可以随意涂画还能插入图片声音输出pdf，办公做笔记应该更方便好用吧。
第五是电池续航，有时候会遇到比较长的会议或上课时间，不考虑外接移动电源的情况下应该是苹果更优。
最后显示效果，两者都不错，都可满足了。
这样看下来，其实ipad和surface 各有所长，各有优点但是都不会差到哪去，个人觉得如果做随笔等比较碎片化的笔记，ipad更合适，如果是做比较专业性系统性连续工作的还是surface 更胜一筹，个人看法，仅供参考。
如果你是学生可以选择ipad,如果你工作了，那就是surface.原因很简单，ipad最大优势是做笔记，但是你确定你开会的时候你用ipad吗，还是必须和别人一样用纸质笔记本，还有向客户展示你的东西，ppt.插U盘，投影仪，你感觉你用pad好吗
我二个本都有，出门基本上用11的iPad pro，本尺寸小，携带方便，电池够长，打开即用。surface休眠后经常半天起不来，不愿意用了，但真编辑较大的PPT文件，又会用surface，主要是鼠标问题呀，期待IOS13能用鼠标。
看自己使用习惯。习惯Win就sf，习惯苹果系统办公就选择pro，iPadpro马上支持刷机电脑系统了。
surface續航太差了,还会在睡眠的时候掉电。